در پیام رییس سازمان صداوسیما آمده است:
«انا لله و انا الیه راجعون
برادر گرامی جناب آقای دکتر احمد توکلی
عضو محترم مجمع تشخیص مصلحت نظام
درگذشت فرزند عزیز جنابعالی، آقای محمد توکلی را تسلیت عرض می‌کنم و از خداوند تعالی برای آن فقید سعید غفران و رحمت الهی و برای بازماندگان صبر و اجر مسئلت دارم.»
محمد توکلی پس از تحمل یک دوره بیماری در بیمارستان نمازی شیراز درگذشت.